Спайковый белок варианта A.30 SC0V2 сильно мутирован и с высокой эффективностью
budetlyanin108 — 28.10.2021
от индуцированных в@кцин0й антител
По сравнению с белком S SC0V-2 B.1, который циркулировал на ранней стадии пандемии, белок S варианта A.30 содержит 10 аминокислотных замен и пять делеций (рис. 1a и дополнительная информация, S1a ). Все делеции вместе с четырьмя заменами обнаружены в N-концевом домене поверхностной единицы S1, которая содержит антигенный суперсайт, на который нацелены большинство нейтрализующих антител, не направленных против рецепторсвязывающего домена (RBD) [ 5 ]. Кроме того, три мутации расположены внутри RBD, который связывается с клеточным рецептором ACE2 и составляет главную мишень нейтрализующих антител (рис. 1a ). Две из этих мутаций, T478R и E484K, расположены близко к сайту связывания ACE2 (дополнительная информация, рис. S1a.), и известно, что E484K снижает восприимчивость к нейтрализации, опосредованной антителами. Наконец, две мутации расположены близко к сайту расщепления S1 / S2, и одна мутация обнаружена в трансмембранной единице S2, которая облегчает слияние вирусной оболочки с клеточными мембранами (рис. 1a ).
Тестирование моноклональных антител, направленных против белка S и используемых для терапии C19, показало, что B.1.351 был устойчив как к бамланивимабу, так и к этесевимабу, как и ожидалось [ 3 ], и что B.1.525 был устойчив к бамланивимабу (рис. 1c ). А.30 также был устойчив к бамланивимабу, но был чувствителен к ингибированию смесью бамланивимаба и этесевимаба (рис. 1c ). Кроме того, B.1.351 показал заметно сниженную нейтрализацию антителами, индуцированными при инфицировании, как и ожидалось; [ 3] уклонение от нейтрализации A.30 и B.1.525 было немного (A.30) или умеренно (B.1.525) менее эффективным (рис. 1d и дополнительная информация, рис. S2 ). Напротив, A.30 был более устойчив к нейтрализации антителами, индуцированными гомологичной вак ChAdOx1 nC0V-19 (Vаxzеvria) или ВNT162b2 (C0mirnаty) по сравнению с B.1.351, но чувствительность к нейтрализации B.1.525 была примерно в том же диапазоне, что и из B.1.351 (рис. 1e и дополнительная информация, рис. S2 и таблица S1 ). Наконец, все протестированные варианты продемонстрировали сниженное и сопоставимое уклонение от антител, вызванное гетерологичной вак — цией ChAdОx1 nC0V-19 / ВNT162b2, в соответствии с результатами, опубликованными для варианта Дельта (B.1.617.2) [7 ].
Таким образом, A.30 демонстрирует предпочтение клеточной линии, не наблюдаемое для других вирусных вариантов, и эффективно избегает нейтрализации антителами, вызванными вак — цией ChAd0x1 nC0V-19 или ВNT162b2. Вхождение SC0V-2 в клеточные линии зависит от активации белка S клеточными протеазами катепсином L или TMPRSS2 [ 8 ], и считается, что активация последней поддерживает распространение вируса в легких. Таким образом, следует отметить, что усиление входа A.30 наблюдалось для линий клеток с катепсином L (Vero, 293 T, Huh-7, A549 клетки), но не TMPRSS2 (Calu-3, Caco-2) -зависимым входом [ 8 ]. Таким образом, можно предположить, что A.30 может использовать катепсин L с повышенной эффективностью и небольшой (но не статистически значимой) резистентностью A.30 против ингибитора катепсина L MDL 28170, что подтверждает эту возможность (Дополнительная информация , рис. S1c ). Примечательно, что устойчивое проникновение в клеточные линии сочеталось с высокой устойчивостью к антителам, индуцированной после вак — ции ChAd0x1 nC0V-19 или ВNT162b2. Устойчивость к нейтрализации превышала таковую у варианта Beta (B.1.351), который заметно устойчив к нейтрализации в культуре клеток и, по сравнению с вариантом Alpha (B.1.1.7), менее хорошо ингибируется вак ChAd0x1 nC0V-19 [ 9 ]. Тем не менее, гетерологичная вак — ция ChAd0x1 nC0V-19 / ВNT162b2, которая, как ранее было показано, усиливает нейтрализующие реакции антител против ЛОС по сравнению с соответствующими гомологичными вак — ями [ 7 , 10], может предложить надежную защиту от варианта A.30. В совокупности наши результаты показывают, что вариант SC0V-2 A.30 может ускользать от контроля с помощью вак-индуцированных антител и может проявлять повышенную способность проникать в клетки L-зависимым образом от катепсина, что может особенно способствовать внелегочному распространению. Как следствие, потенциальное распространение варианта A.30 требует тщательного наблюдения и быстрого принятия контрмер.
Примечание: Все сокращение, замены и др. выполнены автором блога
и не имеют никакого отношения к публикациям. Сделано это по причине
цензуры в некоторых соцсетях, которые борются с любым упоминаем
ранней терапии и соответствующих лекарств.
Подписывайтесь на мою страницу, всегда последние РКИ, КИ, обзор
мировой прессы, статьи и рекомендации о передовых методах лечения
К19 : https://www.facebook.com/veniamin.zaycev/
Здесь собрано все, что будет вам интересно, все объяснено в
закрепленном посте, там же есть и схема-таблица с алгоритмом и
применении иве:
https://www.facebook.com/ashominfo
Группа в фб «Так победим!» все вопросы по иве и ранней
терапии:
https://www.facebook.com/groups/293522279068895
Телеграм-канал «Так победим!» на случай потери связи, там
публикуется то, что идет в ЖЖ и не всегда идет в ФБ:
https://t.me/takpobedimsvz
Чат по иве и ранней терапии в телеграме:
https://t.me/takpobedi
Как согласовать перепланировку помещений в 2025: понятным языком 
«Сотовики» и операторы дата-центров ускорят рост рынка выделенных серверов 
Из разряда "... а что, так можно было," 
Арифметика и история - главные враги Владимира Владимировича 2.0 
Картинки Московского Метрополитена 
От Медведково до Улицы 1905 года. 
Мой воскресный рисунок. Скамейка у красного куста 
просто так 
Про химика Бутлерова 
