Использование больших данных секвенирования для выявления хронических инфекций

топ 100 блогов budetlyanin10819.07.2023

Большинство сильно различающихся вариантов SC0V-2 возникли во время хронических инфекций у людей с ослабленным иммунитетом. Новое исследование показало, что > 70% адаптивных мутаций, присутствующих в циркулирующих в настоящее время вариантах, обнаружены в хроноподобных ветвях BA.1 1. Собственно об этом говорил с самого начала, что так и будет и необходим масштабный популяционный ответ как профилактический так и ранняя терапия. Но ничего этого сделано не было. А теперь имеем, то, что имеем.

Использование больших данных секвенирования для выявления хронических инфекций

                                                                ***

Эволюция SC0V-2 характеризовалась периодическим появлением сильно отличающихся вариантов, многие из которых могли возникнуть во время хронических инфекций у людей с ослабленным иммунитетом. Здесь мы используем глобальную филогению примерно 11,7 миллионов геномов SARS-CoV-2 и ищем клады, состоящие из последовательностей с идентичными метаданными (местоположение, возраст и пол), охватывающих более 21 дня. Мы предполагаем, что такие клады представляют собой повторные выборки от одного и того же хронически инфицированного человека. Был сделан вывод о наборе из 271 такой хроноподобной клады, которая демонстрировала признаки повышенной скорости адаптивной эволюции в соответствии с подтвержденными хроническими инфекциями. Более 70% адаптивных мутаций, присутствующих в циркулирующих в настоящее время вариантах, обнаруживаются в хроноподобных кладах BA.1, которые предшествуют циркулирующим вариантам на несколько месяцев. демонстрируя прогностический характер таких клад. Мы обнаружили, что в хроноподобных кладах вероятность наблюдения адаптивных мутаций примерно в 10-20 раз выше, чем в глобальных цепях передачи. Затем мы используем языковые модели, чтобы найти мутации, наиболее предсказывающие хронические инфекции, и использовать их для вывода сотен дополнительных хроноподобных клад в отсутствие метаданных и филогенетической информации. Предлагаемый нами подход представляет собой инновационный метод добычи обширных данных секвенирования и предоставления ценной информации о будущих эволюционных моделях.

Примечание: Все сокращение, замены и др. выполнены автором блога и не имеют никакого отношения к публикациям.(обычно в начале публикации и в заголовке). Сделано это по причине цензуры в некоторых соцсетях, которые борются с любым упоминаем ранней терапии и соответствующих лекарств.(в них идет скрин из т/к)

Отказ от ответственности: я не защищаю читателей, употребляющих иве или какие-либо другие препараты. Я не врач, а биохимик по образованию и никому не даю медицинских советов. Прежде чем принимать какие-либо лекарства, всегда консультируйтесь с лечащим врачом, которому доверяете.

ПОМНИТЕ. Вы находитесь под защитой Нюрнбергского кодекса и Хельсинской декларации. Хельсинкская декларация делает центральным документом этической исследовательской деятельности информированное согласие. Декларация определяет не только приемлемость известных и исследованных методов лечения, но принципы лечения больного альтернативными методами, к примеру, параграф 37 призван регулировать случаи, «когда не существует проверенного профилактического, диагностического или терапевтического метода. Когда существующие методы оказываются неэффективными, врач, получив обоснованное согласие пациента, должен иметь право применять непроверенные или новые профилактические, диагностические и терапевтические меры, если, по его мнению, они дают надежду на спасение жизни, восстановление здоровья или могут облегчить страдания. По мере возможности такие меры должны быть исследованы на предмет их безопасности и эффективности. Во всех случаях всю новую информацию следует регистрировать и, при необходимости, публиковать».

Полный текст ХД: https://budetlyanin108.livejournal.com/3489319.html

Подписывайтесь на мою страницу, всегда последние РКИ, КИ, обзор мировой прессы, статьи и рекомендации о передовых методах лечения К19 : https://www.facebook.com/veniamin.zaycev/

Здесь собрано все, что будет вам интересно, все объяснено в закрепленном посте, там же есть и схема-таблица с алгоритмом и применении иве:
https://www.facebook.com/ashominfo

Группа в фб «Так победим!» все вопросы по иве и ранней терапии:
https://www.facebook.com/groups/293522279068895

Телеграм-канал «Так победим!» на случай потери связи, там публикуется то, что идет в ЖЖ и не всегда идет в ФБ:
https://t.me/takpobedimsvz

Чат по иве в телеграме:
https://t.me/takpobedi

ЖЖ: https://budetlyanin108.livejournal.com/

"Книга отзывов"

часть 1: https://budetlyanin108.livejournal.com/3118230.html

часть 2: https://budetlyanin108.livejournal.com/3118949.html

часть 3: https://budetlyanin108.livejournal.com/3211902.html

часть 4: https://budetlyanin108.livejournal.com/3417765.html

Ссылки по детоксикации спайк-белка:

https://budetlyanin108.livejournal.com/3144742.html

https://budetlyanin108.livejournal.com/3260643.html

РУБРИКАТОР чата Телеграм-канала «Так победим!»


Оставить комментарий

Архив записей в блогах:
У нас сегодня внезапно манты. Ну ооооооочень внезапно, да. Я вообще, чесгря, не люблю мелкой возни с тестом. Вот эти все пельмени, вареники, печеньки, которые надо пальцами много часов подряд вылепливать - совсем не для меня. Размаху мне в них не хватает ;) Но вчера кое-кто меня на подвиг ...
На этой неделе я озабочен политическим будущим США. Переживаю, что одна из наших двух основных партий стремительно превращается в культ личности самого непопулярного и некомпетентного президента в современной истории страны. Если раньше республиканцы могли назвать себя партией большого ...
Воскресенье. 16 марта 2019 года. С вами Эхо Мацы. Что у нас к этому часу. На мой взгляд, главное событие, доклад Марко Рубио руководству о текущей внешне-политической ситуации. Госсекретарь Соединённых Штатов Марко Рубио и глава МИД России Сергей Лавров в субботу провели ...
Астра ...
Минутка качественной эльфийской ылиты. Собирался написать о другом, но вчера с грохотом рухнула карьера исполнительной ТП по фамилии Трасс, продержавшейся в кресле островного премьер-министра антирекордные 45 дней. Недавно уже высказывал в комментах предположение, что букингемские ...