Тестирование Т-клеточного иммунитета против SARS-CoV-2 можно упростить
prof_afv — 05.09.2021
Проблемы тестирования Т-клеточных иммунных ответов далеко не исчерпываются тем, что упомянуто в предыдущем посте (https://prof-afv.livejournal.com/91745.html ). Но углубление в эту тему требует всё большего отхода от популярного уровня. А мне бы не хотелось превращать этот блог в подобие научного семинара для студентов магистратуры/докторантуры (хотя и студентам ознакомиться с некоторыми моими постами не помешало бы). Поэтому многочисленные методические и интерпретационные проблемы Т-клеточных тестов я временно отставляю в сторону. Надеюсь того, что уже сказано, достаточно для понимания сложности вопроса и «незрелости» этой области для широкого практического применения. Сегодня материал «из той же оперы», но проще для понимания. Речь пойдёт о двух недавно опубликованных интересных статьях.
Упрощённое тестирование Т-клеточного ответа
Эта статья опубликована в журнале Journal of Clinical Investigations (https://www.jci.org/articles/view/152379 ). Авторы убедительно продемонстрировали, что тестирование Т-клеточных иммунных ответов может проводится с использованием образцов цельной крови, т.е. без предварительного выделения лимфоцитов и других мононуклеарных клеток (что на протяжении многих лет считалось обязательным). Казалось бы мелочь, но это делает Т-клеточные тесты намного доступнее для клинических исследований и практики. На рисунке ниже (из статьи) схематически представлено сравнение «простого» (whole blood) и «стандартного» (ELISPOT) тестов. В первом случае работа занимает около 3х часов и до получения результата требуется менее 24 часов; во втором, это занимает около 10 и 36 часов, соответственно. Методика существенно упрощается, а вместе с эти уменьшается и возможность ошибок оператора.
В обоих тестах используются одинаковые антигены – смеси перекрывающихся пептидов (pool 1-7), каждая из которых «содержит» Т-эпитопы различных областей/доменов белка S.
Результаты обоих тестов были сходными. Это хорошо документировано в статье. Помимо чисто методических разработок, в этой статье есть и интересные данные о выраженности Т-реактивности против белка S у переболевших COVID-19 и привитых вакциной PfizerBioNTech. В сопоставимые сроки их средние значения в этих группах оказались приблизительно одинаковыми. Но, к сожалению, индивидуальная вариабельность Т-клеточных ответов была очень высокой, что значительно затрудняет клинически значимую интерпретацию результатов тестирования. Ещё один результат этого исследования из разряда «хотелось бы, чтобы было наоборот» – не было обнаружено корреляции между титрами нейтрализующих антител и выраженностью Т-клеточных ответов на S-белок.
Иммунодоминантный Т-клеточный эпитоп S-белков общий для SARS-CoV-2 и «банальных» коронавирусов человека
Эта статья опубликована на днях в Science (https://www.science.org/doi/10.1126/science.abh1823 ). Авторы пытались разобраться в деталях перекрёстной реактивности Т-клеточных ответов на различные коронавирусы человека – относительно безобидные (их пока называют «сезонными») и SARS-CoV-2. То, что у некоторых людей, достоверно не переносивших инфекцию SARS-CoV-2, есть Т-клетки, реагирующие на антигены последнего, было хорошо известно (об этом у меня был пост: https://prof-afv.livejournal.com/35424.html ). Очевидным, и, по сути, единственным, объяснением этому было предположение о наличие общих Т-эпитопов у SARS-CoV-2 и сезонных коронавирусов. Но о конкретике этого феномена почти ничего не было известно. В данном исследовании было установлено, что за существенную, возможно, определяющую часть этой перекрёстной реактивности, ответственен лишь один Т-эпитоп (поэтому его назвали иммунодоминантным). В spike-белке SARS-CoV-2 этот эпитоп «располагается» в аминокислотной последовательности, координаты которой 816-830 (соответсвенно, его назвали S816-830). На эпитоп S816-830 реагировали Т-клетки 20% SARS-CoV-2-отрицательных индивидуумов, до 60% людей, перенесших COVID-19 и 97% привитых вакциной PfizerBioNTech. Углублённая характеристика Т-клеточного ответа на S816-830 у переболевших и вакцинированных свидетельствовала о том, что эти ответы были вторичными – типа «буста» после «прайма» при предшествующем инфицировании обычными коронавирусами. Связан ли Т-клеточный ответ на S816-830 с протективностью пока не ясно. Если такая ассоциация будет установлена, тестирование Т-клеточных ответов на SARS-CoV-2, приобретёт столь желанное клиническое значение и методически существенно упростится (отпадёт необходимость в использовании смесей множества пептидов). Но это оптимистический сценарий…
Проф_АФВ
|
|
</> |
Целительная сила пара: как баня и сауна укрепляют здоровье и продлевают молодость 
Осталась 
Утренний глоток поэзии 
Кравчук. Через 5 лет будет как во Франции! 
WIP Плед из бабушкиных квадратов 
Хранители истории небесной техносферы: В Новосибирске возвращают к жизни 
Моя преле-с-с-сть! 
Несколько красивых фото 
Обрести 
