На поверхности молекулы
vladimir101 — 24.01.2010Это карта подвижности на поверхности "нехорошего" белка. Компьютеры работали неделю, чтобы получить эту картинку.
Из разговора с друзьями
- Ни на что не хватает времени. Читаю только то, что сам пишу! Из-за этого читать приходится много.
Это сказал мой друг математик. Я подумал, что у меня сейчас примерно так же.
Молекула
Придумал как на одном рисунке показать динамику белковой молекулы. Эти молекулы не обладают жесткой структурой, а все время дышат. Благодаря этому они могут подстраиваться под другие молекулы, которые к ним приближаются, и «захватывать их в плен». Эти динамические свойства чрезвычайно важны, не зная их нельзя говорить о биологической активности молекулы, насколько она полезна или вредна в нашем организме, и как с ней бороться, если она причиняет нам вред.
Я предложил поверхность молекулы белка представлять, как физическую карту мира. Чем ярче пятно на этой карте, тем более подвижна структура в этой точке поверхности. Можно представить, что в ярких пятнах постоянно происходят страшные землетрясения и ураганы, а темные пятна соответствуют «тихим омутам».
На рисунке карта подвижности молекулы белка, который делает раковые клетки неуязвимыми для нашей иммунной системы. Я заметил, что в активном центре белка, то есть в области, которой белок цепляется за поверхности клеток (в том числе раковых), подвижность огромна (на карте это где-то в «районе Китая»).
Кому интересно, то вот ссылки на посты о нашей проблеме
http://blogs.mail.ru/mail/vadaragan/7E923DB7835FFB8C.html
http://blogs.mail.ru/mail/vadaragan/42256F74978FD0BA.html
Это открывает новые перспективы создания лекарств. Можно не затыкать дырки в белке, как мы пытались делать в последний год, а попробовать уменьшить подвижность на поверхности, то есть притушить землетрясения. Это резко снизить активность белка, что нам и требуется.
А задача уменьшения подвижности поверхности белка на порядок более простая, чем подбор затычки для дырки.