Интеграция ДНК, зараженной к0р0навирусн0й "в", в геном клеточной линии человека

топ 100 блогов budetlyanin10824.03.2024
Интеграция ДНК, зараженной к0р0навирусн0й в, в геном клеточной линии человека

Это второе исследование известного японского ученого Хироши Аракавы. Первое здесь: https://budetlyanin108.livejournal.com/3554205.html

Напомню, бэкграунд Хироши Аракавы, чтобы вы не сомневались в его компетенции.  1991 Окончил факультет естественных наук Киотского университета. 1996 Доктор наук Киотского университета (молекулярная биология, иммунология). Базельский институт иммунологии (Базель), Институт Генриха Петте (Гамбург), Институт Гельмгольца (Мюнхен), Институт Макса Планка (после поступления в Институт молекулярной онкологии (Мюнхен), он поступил на работу в Институт молекулярной онкологии (Милан).

Суть проблемы зараженной ДНК в вакцинах от коронавируса заключается в их способности модифицировать геном человека. Чтобы проверить эту возможность, доктор Ульрике Кеммерер провела эксперимент, в котором вакцины против короны вводили линиям раковых клеток MCF7 и OVCAR-3. Доктор МакКернан, которого консультировал доктор Кеммерер, провел эксперимент по обнаружению примеси ДНК в этих клеточных линиях. Он также сообщает в своем блоге о первом случае интеграции загрязняющей ДНК в геном линии раковых клеток. Меня это заинтересовало, поэтому я решил повторно проанализировать событие рекомбинации ДНК, которое обнаружил доктор МакКернан. В этой статье мы также представим результаты анализа.

Рисунок 1
Рисунок 1

Рисунок 1

Доктор Кеммерер ввел вакцину против коронавируса Pfizer и AstraZeneca в линию клеток опухоли яичника OVCAR-3 и после субкультуры подтвердил экспрессию шиповидного белка с помощью иммуногистохимического окрашивания. Глубокое секвенирование стоит дорого. Поэтому перед проведением экспериментов по обнаружению ДНК необходимы предварительные эксперименты. Доктор МакКернан сначала проверял клетки после лечения вакциной с помощью кПЦР и нацеливался на кПЦР-положительные клетки для глубокого секвенирования.

Загрязняющая ДНК, которая не интегрируется в геном, субкультивируется и разбавляется. Действительно, значение Ct вектора при первом пассаже составляло 30,28, а при втором пассаже — 34,72. Разница в 4Ct составляет 16 раз, и во втором пассаже концентрация значительно ниже. Доктор МакКернан извлек ДНК из клеток, которые были дважды субкультивированы, и провел глубокое секвенирование. В данных секвенирования были обнаружены SV40, начало репликации и спайковая ДНК. Спайковая ДНК была обнаружена с 3000-кратным охватом в полногеномной библиотеке образцов, обработанных вакциной. (Охват относится к проценту всех пар оснований или локусов в геноме, которые охвачены секвенированием.) Охват человеческого генома составил 30 раз, поэтому существует избыточное количество копий загрязняющей ДНК по сравнению с геномом. Мы можем увидеть, что он вторгся в клетки.

В результате, как ни странно, глубокое секвенирование выявило SNP (однонуклеотидные полиморфизмы) в точках начала репликации (F1 и SV40) вакцинной плазмиды. Этот SNP не присутствует в вакцинах. Другими словами, плазмида, по-видимому, мутирует внутри клетки. Кроме того, степень охвата глубокого секвенирования области начала репликации выше средней, а наблюдаемое число копий относительно велико, но это повышает вероятность того, что ДНК, взятая в клетки, реплицируется и мутирует. Первоначально репликация ДНК плазмид и SV40 требует наличия специфического фермента, которого нет в клетках человека. Даже в молекулярной генетике обычно не проводятся эксперименты по введению в клетки больших количеств небольших фрагментов ДНК, содержащих точки начала репликации. Из вышеизложенного можно сделать вывод, что внутри клеток может происходить неожиданная репликация ДНК.

На основании глубокого анализа секвенирования, проведенного доктором МакКернаном, в общей сложности наблюдалось два случая интеграции генома в клеточных линиях, получивших вакцину. Отдельные последовательности при глубоком секвенировании называются «чтениями». Данные оказались настолько интересными, что я решил самостоятельно провести повторный анализ лидов.

фигура 2
фигура 2

фигура 2

На рисунке 2 показаны отведения, показывающие интеграцию генома в глубоком анализе секвенирования доктора МакКернана. Целью анализа являются считывания интеграции генома 1 и 2. Большой объем информации можно прочитать даже из данных короткой последовательности. На этот раз мы использовали блат-поиск для сравнения с геномом человека и бласт-поиск для поиска гомологии .

Далее следует мой собственный повторный анализ.

Рисунок 3
Рисунок 3

Рисунок 3

Верхняя часть массива на рисунке 3 — это чтение. Если вы совместите это чтение с хромосомой 12 (черный) и геном спайка вакцины против коронавируса Pfizer (красный), вы увидите, что хромосома 12 (черный) переключена на ген спайка (красный) в середине чтения. И есть короткая идентичная последовательность (в данном случае ГАГАГ), где он переключается. Видно, что загрязненная ДНК и геном человека были рекомбинированы посредством микрогомологического соединения концов (MMEJ). MMEJ включает в себя несколько ферментов репарации ДНК внутри клетки, поэтому эта рекомбинация  не является артефактом in vitro (ошибочным продуктом), и считается, что генетическая рекомбинация произошла внутри клетки.

Геномная интеграция происходит на длинном плече хромосомы 12, и этот локус содержит ген FAIM2. FAIM2 — это ген, который, как предполагается, связан со злокачественным прогрессированием рака. Рекомбинация происходит в интронах (последовательностях, которые не кодируют белки), но неясно, как такие мутации влияют на экспрессию генов.

Рисунок 4
Рисунок 4

Рисунок 4

Другой пример интеграции генома показан на рисунке 4. Когда мы сопоставляем это чтение с хромосомой 9 (черный) и геном спайка (красный), мы видим, что хромосома 9 (черный) переключается на ген спайка (красный) в середине чтения. В этом примере также есть короткая идентичная последовательность (в данном случае TCTGCCCT), в которой происходит переключение. Ведь считается, что загрязненная ДНК и геном человека воссоединились с помощью микрогомологии. Существует несколько путей репарации ДНК, поэтому какой путь репарации используется при включении чужеродной ДНК в геном, зависит от каждого конкретного случая.

Некоторые из считываний все еще содержали последовательности адаптера Illumina. Адаптерные последовательности представляют собой последовательности, добавляемые в ПЦР-амплификацию и секвенирование ДНК для глубокого секвенирования. Адаптерные последовательности обычно удаляются во время анализа, но часто остаются в чтении из-за недостаточного удаления.

Интеграция загрязненной ДНК в геном происходит вблизи центромер. Позвольте мне немного объяснить центромеры. Хроматиды (сестринские хроматиды) — это две хромосомы с одинаковой генетической информацией, образующиеся после репликации ДНК. Хроматиды остаются связанными до тех пор, пока хромосомы не разделятся во время деления клетки, а области ДНК, где они соединяются, называются центромерами. Таким образом, центромеры являются важными участками сегрегации и сегрегации хромосом.

Рисунок 5
Рисунок 5

Рисунок 5

На рис. 5 показан интегрированный в геном фрагмент ДНК гена спайка. Последовательности, обнаруженные в считываниях геномной интеграции шипового гена вакцины против коронавируса Pfizer, отмечены красным. Из-за ограничений длины чтения фактические интегрированные последовательности, вероятно, будут еще больше. Интегрированная последовательность является частью гена шипа и не может образовывать полноразмерный белок шипа. Однако невозможно предсказать, в какой участок генома будет вставлена ​​зараженная ДНК и какие последствия это будет иметь.

Рисунок 6
Рисунок 6

Рисунок 6

Кариотип относится к размеру, форме и количеству хромосом. Хромосомы человека состоят из 46 хромосом, включая 22 пары аутосом и одну пару половых хромосом. Аутосомы нумеруются в порядке размера: хромосома 1, хромосома 2, хромосома 22 и так далее. Места интеграции загрязненной ДНК находятся вблизи центромеры хромосомы 9 и локуса FAIM2 на длинном плече хромосомы 12.

Хотя наблюдаемые здесь интеграции генома являются первыми двумя в экспериментах с использованием культивируемых клеток, специфическая идентификация рекомбинантных последовательностей загрязненной ДНК с геномом человека является большим достижением. Дальнейшие проверочные эксперименты, вероятно, продолжатся и в будущем. Неизвестно, в каких генных локусах генома действительно происходит интеграция генома, показанная на рисунке 6. Это настоящая «атака из дробовика на геном». То, что происходит в культивируемых клетках, может происходить и в нормальных клетках, и в зависимости от места интеграции генома может возникать широкий спектр аномалий. Первой прогнозируемой аномалией является индукция рака или злокачественной трансформации. Затем в течение длительного периода времени проявляются различные генетические заболевания.

Известно, что факторы, вызывающие повреждение генома, включают, например, радиационное воздействие, но модификация генома загрязненной ДНК происходит из-за искусственно созданных фрагментов гена и отличается от случайных мутаций, вызванных радиацией. Этот эксперимент с использованием культивируемых клеток можно назвать микромиром интеграции в геном загрязненной ДНК. Реальность такова, что «эксперименты по трансфекции зараженной ДНК» проводились на огромном количестве людей по всему миру под предлогом вакцинации. Модификация человеческого генома является наиболее серьезной причиной вреда, причиняемого препаратами мРНК, и в будущем она, вероятно, останется в истории как «первородный грех» человечества.

Спасибо всем, кто находит этот пост полезным. Подпишитесь на т/к «Так победим! Статьи»

Учитывая возросший интерес к статинам добавил три ссылки в конце. Дополнительную информацию можно получить если воспользоваться функцией «поиска» у меня в ЖЖ.

Примечание: Все сокращение, замены и др. выполнены автором блога и не имеют никакого отношения к публикациям.(обычно в начале публикации и в заголовке). Сделано это по причине цензуры в некоторых соцсетях, которые борются с любым упоминаем ранней терапии и соответствующих лекарств.(в них идет скрин из т/к)

Отказ от ответственности: я не защищаю читателей, употребляющих иве или какие-либо другие препараты. Я не врач, а биохимик по образованию и никому не даю медицинских советов. Прежде чем принимать какие-либо лекарства, всегда консультируйтесь с лечащим врачом, которому доверяете.

ПОМНИТЕ. Вы находитесь под защитой Нюрнбергского кодекса и Хельсинской декларации. Хельсинкская декларация делает центральным документом этической исследовательской деятельности информированное согласие. Декларация определяет не только приемлемость известных и исследованных методов лечения, но принципы лечения больного альтернативными методами, к примеру, параграф 37 призван регулировать случаи, «когда не существует проверенного профилактического, диагностического или терапевтического метода. Когда существующие методы оказываются неэффективными, врач, получив обоснованное согласие пациента, должен иметь право применять непроверенные или новые профилактические, диагностические и терапевтические меры, если, по его мнению, они дают надежду на спасение жизни, восстановление здоровья или могут облегчить страдания. По мере возможности такие меры должны быть исследованы на предмет их безопасности и эффективности. Во всех случаях всю новую информацию следует регистрировать и, при необходимости, публиковать».

Полный текст ХД: https://budetlyanin108.livejournal.com/3489319.html

Подписывайтесь на мою страницу, всегда последние РКИ, КИ, обзор мировой прессы, статьи и рекомендации о передовых методах лечения К19 : https://www.facebook.com/veniamin.zaycev/

Здесь собрано все, что будет вам интересно, все объяснено в закрепленном посте, там же есть и схема-таблица с алгоритмом и применении иве:
https://www.facebook.com/ashominfo

Группа в фб «Так победим!» все вопросы по иве и ранней терапии:
https://www.facebook.com/groups/293522279068895

Телеграм-канал «Так победим!» на случай потери связи, там публикуется то, что идет в ЖЖ и не всегда идет в ФБ:
https://t.me/takpobedimsvz

Чат по иве в телеграме:
https://t.me/takpobedi

ЖЖ: https://budetlyanin108.livejournal.com/

"Книга отзывов"

часть 1: https://budetlyanin108.livejournal.com/3118230.html

часть 2: https://budetlyanin108.livejournal.com/3118949.html

часть 3: https://budetlyanin108.livejournal.com/3211902.html

часть 4: https://budetlyanin108.livejournal.com/3417765.html

Ссылки по детоксикации спайк-белка:

https://budetlyanin108.livejournal.com/3144742.html

https://budetlyanin108.livejournal.com/3260643.html

https://budetlyanin108.livejournal.com/3596796.html

Детокс аутофагией:

https://budetlyanin108.livejournal.com/3613550.html

Назальные спреи

https://budetlyanin108.livejournal.com/3612201.html

РУБРИКАТОР чата Телеграм-канала «Так победим!»

Обзор противоопухолевых свойств перепрофилированных препаратов

В связи с тем, что участились просьбы дать ссылки на научные статьи и исследования по применению тех или иных перепрофилированных препаратов против рака, сделал этот пост на основе публикаций в моем ЖЖ. Возможно всё не удастся втиснуть в один пост из-за ограничений по количеству знаков (лимит 80К знаков), но можно будет воспользоваться «поиском» у меня в ЖЖ по ключевым словам для получения дополнительной информации.

https://budetlyanin108.livejournal.com/3655521.html

О СТАТИНАХ

Чем заменить статины
https://budetlyanin108.livejournal.com/3666513.html

Прежде чем принимать статины...
https://budetlyanin108.livejournal.com/3691623.html

СТАТИНЫ — величайший обман человечества
https://budetlyanin108.livejournal.com/3604461.html

Оставить комментарий

Архив записей в блогах:
Новое правительство Украины официально кем-то признано?  Я что-то ничего  не могу на это счет.  Апд. Вопрос в том, а нужно ли вообще его признавать другим государствам, ведь все оформлено так, что никакого переворота нет. Рада Януковичу объявила импичмент вроде. Связан ...
В банковской практике есть такое условие в кредитовании - запрет на досрочное погашение кредита заемщиком. Кто-нибудь знает, в чем подвох такого условия? По идее, если человек или компания берет кредит на какой-то срок, но затем появляется возможность выплатить его быстрее, логично, что ...
Знаю, что не совсем по теме сообщества, но понимаю, что в лялечке меня закидают тухлыми помидорами! Поэтому спрошу здесь. Как Вы считаете, соска с первых дней жизни- это зло? Я читаю разные статьи и мнения расходятся. В одних утверждается, что до ...
Евгений Липович (http://lipovich.livejournal.com/30662.html) написал про велодорожки: «Сразу скажу: «Велодорожки нужны». С каждым годом любителей перемещения по городу на велосипедах становится все больше и больше. И не обращать внимания на этот факт нельзя. В ...
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- В прошлом году предпоследний день перед Новым годом Колобок провёл с Платошкиным, в этом году   -  с Андреем Паршевым и своей ...