Вскоре было принято решение присоединить артель к другим предприятиям, чтобы лишить её самостоятельности.

Это помешало бы подпольщикам продолжать диверсионные акции, поэтому Батюк организовал протест рабочих, но был снят с должности.

В ответ на это он активизировал подпольную деятельность.

Узнав о существовании в нежинских лесах партизанского отряда, Яков Батюк в марте 1942 года встретился с его командиром, секретарём Носовского подпольного райкома партии Стратилатом.

После этого подпольщики развернули агитационно-пропагандистскую работу среди населения.

Подпольная организация направила в ряды народных мстителей почти 60 человек, в частности 15 военнопленных, работавших в немецком госпитале.

Гестапо вышло на след нежинских патриотов, и 25 августа 1943 года большинство членов комсомольско-молодежной организации во главе с Батюком была арестована.

Только небольшая группа выбралась из города и присоединиться к партизанскому отряду.

В ночь с 6 на 7 сентября двумя грузовыми машинами все 26 арестованных подпольщика были вывезены к железнодорожной станции, где у разрушенной водокачки они были расстреляны.

15 сентября Нежин был освобождён.