Персистирующий ковид

chuka_lis — 03.03.2021 — Коронавирус Или хронический.
Свежий препринт, в котором показано, что у нескольких человек (пациенты, нуждающиеся из-за своих заболеваний в химиотерапии, 5,5, и 25 лет, имевшие несчастье заболеть ковидом-19) с ослабленной иммунной системой, коронавирус САРС2 персистировал примерно до полугода, и выделялся, разумеется.
Для определения вируса делали обычный ПЦР, количественный, и на "отрицательную" нить РНК (показывающую что есть репликация вируса внутри клеток), и еще и анализ генома, чтоб проверить мутации. А что оставался заразным- проверяли на культуре и по показателю внутриклеточной репликаации. Еще,  у тех, у кого вирус долго жил,  он приобретал во время персистенции мутации (примерно как в этом вот случае), в том числе и те, которые могут позволять ему лучше уходить от иммунного ответа (который какой-никакой, был у этих больных). Такие вот дела.
У девочки 5 лет, когда она попал в больницу, был выскоий уровень виурса в мазке и мазок был "заразный". Потом, количество вируса постепенно упало и было низким- и не было заразности. Антитела появились через полтора месяца, как раз к тому времени, и стал исчезать вирус, мазок стал негативным, а и их титры росли, и были высокими и через полгода. Нейтрализующие антитела работали отлично.
У 2го пациента (20-25 летний)- уровни вируса были стабильные, как и заразность, на протяжении полугода. Не смотря даже на 2 курса ремдесивира и еженедельные лечения плазмой крови переболеших. Антител у него было мало, причем только 1 типа, чуть выше порога IgG, и все. После вливаний плазмы антикоронавирусные уровни IgG повышались, но снижались довольно быстро. И нейтрализующая способность антител была низкая.
3 пациент, мальчик 5 лет, так же был заразен примерно на одинаковом уровне, полгода, хотя через 2.5 месяца у него уже появились "свои" антитела, еще 4 месяца он продолжал выделять вирус. Культурировался вирус из мазков периодически, чередуясь с неспособностью культурироваться. Но постоянно были доказательства, что есть репликация вируса в клетках самого мальчика. IgG у него появился слабенький, и так и был, а вот IgМ был очень высокий. Правда, IgG на низком уровне оставался почти все время с тех пор, как появился, а остальные типы антител, появившиеся позже обычного, потихоньку сошли на нет. Однако, нейтрализующая активность антител этого ребенка, тоже не была постоянной.
В принципе, у детей, когда появились антитела, они напоминали динамику и уровни как " у обычных" пациентов, только попозже. У контроля (переболевших, но с нормальным иммунитетом), антитела так же показывали по времени разную динамику и способность к нейтрализации (у всех-своя).
Авторы отмечают, что "непостоянство" культурирования, скорее всего, связано с тем, что нельзя каждый раз брать мазки "одинаково" хорошо. Как будут заражать культуры клеток зависит от количества вируса в мазке.
У той девочки, которая имела более "сильный" иммунитет, 1 пациента, вирус успел мутировать, но только в 1 аллели, пока персистировал. А вот у 2 и 3, где условия для размножения в хозяине были "получше", было много мутаций, появлявшихся со временем в разных аллелях.. Часть из них была направлена на совершенствование шипика или уход от антител.
We report two pediatric and one young adult patient with B-cell ALL with remarkably different courses of SARS-CoV-2 infection. Patient 1 had milder symptoms with rapidly declining and nonviable virus and serological evidence of a robust immune response that is representative of a typical COVID-19 clinical course. By contrast, patients 2 and 3 experienced more severe COVID-19 characterized by serological evidence of a weaker immune response with evidence of prolonged infectious virus shedding and mutation accumulation demonstrating emergence of potential escape mutations. Using RT-PCR to detect subgenomic and negative-strand replication 329 intermediates, we were able to identify ongoing replication throughout the samples from patient 2 (up to 144 days) and patient 3 (up to 162 days).Overall the detection of viral intermediates correlated very well with the viral culture data, suggesting these may serve an expeditious molecular surrogate for infectivity. Viral culture was intermittently positive up to day 139 in patient 3. As culturing methods are limited by sample quality and lower sensitivity compared to molecular methods...
Our work demonstrates that immunocompromised pediatric and young adult patients are susceptible to prolonged viral infections with prolonged infectious virus shedding and mutation accumulation. The patients we report are immunocompromised to varying degrees, and support a potential correlation between host immune response and the emergence of viral variants, some of which may have the potential to escape antibody neutralization.
we conclude that the observed expanded intra-host heterogeneity of viral isolates from pediatric and young adult patients with suppressed immunity and correspondingly prolonged infectionraises the possibility of emergence of variants with the potential to evade immune responses elicited during the course of infection or induced by vaccine.
да и вся дискуссия ползна к прочтению.
We found compelling evidence of ongoing replication and infectivity for up to 162 days from initial positive by subgenomic RNA, single-stranded RNA, and viral culture analysis. Our results reveal a broad spectrum of infectivity, host immune responses, and accumulation of mutations, some with the potential for immune escape. Interpretation Our results highlight the need to reassess infection control precautions in the management and care of immunocompromised patients. Routine surveillance of mutations and evaluation of their potential impact on viral transmission and immune escape should be considered.

Оставить комментарий

Популярные посты:

• Архив