очевидное

overscience_mes — 06.10.2013 Меня, что-то, достали причитания о невоспроизводимости результатов в современной биологии. Помимо чистой лажи и притягивания за уши, есть еще феномен чисто биологических сложных систем, с которым надо жить.

Рассмотрим пример невоспроизводимости на простейшем примере.
Задача: Вам надо порезать ДНК на кусочки. Все очень просто, есть белок-рестриктаза, или эндонуклеаза рестрикции, которая с этим легко справляется, если ее добавить к ДНК в соответствующем буфере. Таким образом, нужно смешать четыре компонента в одной пробирке и подержать при нужной температуре.

Нет, конечно, правильный биолог добавит сначала буфер к воде, тщательно перемешает, потом ДНК, и к ней фермент. И на выходе получит правильное расщепление ДНК.

Но допустим (рассматриваем альтернативные варианты) : Мы лихо взялись за дело, и добавили в пробирку воду и белок, нагрели и начали решили добавить ДНК и буфер. За это время белок денатурировал, и ничем не смог повредить двойным спиралькам, что явно противоречит успехам предыдущих товарищей.

Допустим, мы все сделали как в варианте №1, но перемешали похуже, и получили промежуточную картину, где наблюдались уже три полосы.

Если мы, экономя реактивы, решили провести реакцию в меньшем объеме, то могли добавить непропорционально-большое количество фермента (и буфера в котором он растворен) в смесь, то в белке могли взыграть дремлющие силы, которые вынудили бы его утратить специфичность и кусать ДНК на более мелкие кусочки.

Так же, белок и ДНК могли быть разной чистоты, и примеси вносить дополнительные искажения в наблюдаемую картину.

И все это можно наблюдать в очень простом случае. А теперь представим, что мы можем наблюдать в случае сложных смесей биомолекул, о свойствах которых мало что известно? А теперь вспомним, что единственно правильного способа ставить такого рода эксперименты не существует, и каждый старается как может...

В хороших журналах все это лечится требованиями многоуровневых доказательств, но даже это не является панацеей. В журналах помельче, такого требования нет, и опубликованное в них может иметь отношение к жизни, а может и не иметь. И, Мария, если это все сделать идеально, то больше чем одна мысль - в статью просто не поместится.
А воспроизведется или нет, ну тут уж как повезет.
Мысль побочная, о том, как важно правильно выбирать в биологии то, что делать, ибо таким макаром всю жизнь можно убить на маловажную фигню.

Оставить комментарий

Популярные посты:

• Архив