очевидное

топ 100 блогов overscience_mes06.10.2013 Меня, что-то, достали причитания о невоспроизводимости результатов в современной биологии. Помимо чистой лажи и притягивания за уши, есть еще феномен чисто биологических сложных систем, с которым надо жить.

Рассмотрим пример невоспроизводимости на простейшем примере.
Задача: Вам надо порезать ДНК на кусочки. Все очень просто, есть белок-рестриктаза, или эндонуклеаза рестрикции, которая с этим легко справляется, если ее добавить к ДНК в соответствующем буфере. Таким образом, нужно смешать четыре компонента в одной пробирке и подержать при нужной температуре.

Нет, конечно, правильный биолог добавит сначала буфер к воде, тщательно перемешает, потом ДНК, и к ней фермент. И на выходе получит правильное расщепление ДНК.

Но допустим (рассматриваем альтернативные варианты) : Мы лихо взялись за дело, и добавили в пробирку воду и белок, нагрели и начали решили добавить ДНК и буфер. За это время белок денатурировал, и ничем не смог повредить двойным спиралькам, что явно противоречит успехам предыдущих товарищей.

Допустим, мы все сделали как в варианте №1, но перемешали похуже, и получили промежуточную картину, где наблюдались уже три полосы.

Если мы, экономя реактивы, решили провести реакцию в меньшем объеме, то могли добавить непропорционально-большое количество фермента (и буфера в котором он растворен) в смесь, то в белке могли взыграть дремлющие силы, которые вынудили бы его утратить специфичность и кусать ДНК на более мелкие кусочки.

Так же, белок и ДНК могли быть разной чистоты, и примеси вносить дополнительные искажения в наблюдаемую картину.

И все это можно наблюдать в очень простом случае. А теперь представим, что мы можем наблюдать в случае сложных смесей биомолекул, о свойствах которых мало что известно? А теперь вспомним, что единственно правильного способа ставить такого рода эксперименты не существует, и каждый старается как может...

В хороших журналах все это лечится требованиями многоуровневых доказательств, но даже это не является панацеей. В журналах помельче, такого требования нет, и опубликованное в них может иметь отношение к жизни, а может и не иметь. И, Мария, если это все сделать идеально, то больше чем одна мысль - в статью просто не поместится.
А воспроизведется или нет, ну тут уж как повезет.
Мысль побочная, о том, как важно правильно выбирать в биологии то, что делать, ибо таким макаром всю жизнь можно убить на маловажную фигню.

Оставить комментарий

Архив записей в блогах:
Сколько кошек с непереносимостью лактозы вы встречали в своей жизни? Последнее время много и страстно пишут о том, как вредно для кошек цельное молоко. И о последствиях (вздутие, понос и прочая, и прочая...). Честно – я ни разу в жизни не сталкивалась с подобными результатами. Пьют и ...
Если ехать по М-10 - Москва-Питер - то невооруженным глазом можно заметить, как все величие России очерчивается ровно по фарватеру Волги. Движение времени назад по тайм-лайну строго градировано. Москва - двадцать первый век. Тверь - еще туда-сюда, вторая половина двадцатого. Все, что ...
Если посмотреть новостной фон, то мир каждый день убеждают, что переход на электромобили предрешен. Почти все известные известные автопроизводители регулярно презентуют новые свои электрокары, рапортуют о новых разработках и т. д. Но на этой неделе произошло весьма любопытное событие, ...
Нет, реально надоело. За три последних дня так совсем. Приходишь - в исключительных случаях, потому что я не одержима комментированием, как всем известно - в бложег к извините за выражение френду, никого не трогаешь. Кроме него самогородимого, как ...
Первый вице-премьер Игорь Шувалов: «Там, где отечественные сырье и отечественные продукты, и в 2–3 раза растет цена – оправдания этому нет. Мы будем работать с торговыми сетями, – заявил Шувалов. - Если не будет специального взаимодействия, не будет все-таки налажен диалог, нам придется по ...