очевидное

топ 100 блогов overscience_mes06.10.2013 Меня, что-то, достали причитания о невоспроизводимости результатов в современной биологии. Помимо чистой лажи и притягивания за уши, есть еще феномен чисто биологических сложных систем, с которым надо жить.

Рассмотрим пример невоспроизводимости на простейшем примере.
Задача: Вам надо порезать ДНК на кусочки. Все очень просто, есть белок-рестриктаза, или эндонуклеаза рестрикции, которая с этим легко справляется, если ее добавить к ДНК в соответствующем буфере. Таким образом, нужно смешать четыре компонента в одной пробирке и подержать при нужной температуре.

Нет, конечно, правильный биолог добавит сначала буфер к воде, тщательно перемешает, потом ДНК, и к ней фермент. И на выходе получит правильное расщепление ДНК.

Но допустим (рассматриваем альтернативные варианты) : Мы лихо взялись за дело, и добавили в пробирку воду и белок, нагрели и начали решили добавить ДНК и буфер. За это время белок денатурировал, и ничем не смог повредить двойным спиралькам, что явно противоречит успехам предыдущих товарищей.

Допустим, мы все сделали как в варианте №1, но перемешали похуже, и получили промежуточную картину, где наблюдались уже три полосы.

Если мы, экономя реактивы, решили провести реакцию в меньшем объеме, то могли добавить непропорционально-большое количество фермента (и буфера в котором он растворен) в смесь, то в белке могли взыграть дремлющие силы, которые вынудили бы его утратить специфичность и кусать ДНК на более мелкие кусочки.

Так же, белок и ДНК могли быть разной чистоты, и примеси вносить дополнительные искажения в наблюдаемую картину.

И все это можно наблюдать в очень простом случае. А теперь представим, что мы можем наблюдать в случае сложных смесей биомолекул, о свойствах которых мало что известно? А теперь вспомним, что единственно правильного способа ставить такого рода эксперименты не существует, и каждый старается как может...

В хороших журналах все это лечится требованиями многоуровневых доказательств, но даже это не является панацеей. В журналах помельче, такого требования нет, и опубликованное в них может иметь отношение к жизни, а может и не иметь. И, Мария, если это все сделать идеально, то больше чем одна мысль - в статью просто не поместится.
А воспроизведется или нет, ну тут уж как повезет.
Мысль побочная, о том, как важно правильно выбирать в биологии то, что делать, ибо таким макаром всю жизнь можно убить на маловажную фигню.

Оставить комментарий

Архив записей в блогах:
      Спасибо Виктории Цыгановой и её ноу-нейм приложению, в виде её румяного супруга, за эпичное интервью, данное талантливому мистеру Рипли Дудю*. Начнём с конца, потому как само интервью хоть и длинное, но ёмкое. Укладывается буквально в одно слово. Какое? Об этом ...
Знала я одного парня -- нет, не любила, Джо, ох не любила, да и не знала в сущности, он был всего-то муж моей сослуживицы, -- но, в общем, был у меня один знакомый парень с начисто выбритой головой. У него был прекрасный мускулистый череп, в его ...
Я старая бабка Прокофьева Лида. Домишко под Брянском в предместье Сельца. Лохань моя ссохлась, глухая обида Остаток деньков доживать без конца Опрелый снежок на завалинках тает, Ветрюга осинки озябшие гнёт... Мне хуя, как солнца зимой, не хватает, Мне страшно, что он никогда не придёт ...
Наконец я созрела на отчет)) Вкратце: контракт с ЦТА и 68 роддомом, 2 недели до родов провела в отделении патологии, сделали ЭКС из-за тазового предлежания и стремительно развивающегося маловодия. От услуг акушерки отказалась (как выяснилось, зря...) Подробнее под катом :) Про ...
Отчаялись дождаться починки интернета от Безека. Со вчера на сегодня свалили в Хот, вчера позвонили, сегодня пришли подключать. Как быстро они все умеют работать, когда ты к ним приходишь, и как медленно - когда тебе потом от них что-то надо. Пришли наши иммитаторы e-sim, будем ставить ...