Об особенностях национальных коронавирусных инфекций
partizan_1812 — 29.07.2020
— Коронавирус
Считайте этот пост продолжением моего поста о
некоторых недоумениях касательно коронавирусной статистики.
Известно, что оценка case-fatality risk (CFR) или коэффициента
летальности, который рассчитывается как процент умерших от общего
числа зарегистрированных пациентов с данным заболеванием, обычно
меняется в ходе эпидемии, потому что в ее начале доля завершенных
случаев может быть невелика. Так, если заболело всего 100 человек,
и из этого числя 10 умерло, то летальность заболевания составляет
10%. В начале эпидемии число заболевших может быть уже 90, а
умерших может совсем еще не быть, что приведет к рассчитанному
коэффициенту летальности равному 0%, который со временем
увеличится. Этот коэффициент может быть и завышен (см. ниже). Но
может происходить и действительное изменение коэффициента
летальности, связанное с изменениями в патогенном организме, или
инфицируемой популяции, или способах лечения, или …, или
….Можно оценить летальность, принимая во внимание средний интервал времени между выявлением инфекции и смертью, если она наступает. По данным CDC (главного санэпидуправления США) интервал между появлением симптомов ковида и смертью, с ним связанной, составляет около 14 суток. Между регистрацией случаев инфекции, происходящей обычно с задержкой относительно появления симптомов, и смертью проходит от 5 до 10 суток согласно одной работе, специально посвященной этому вопросу. (См. об этом в предыдущем посте.)
В этот раз я прикинул летальность при ковиде для разных стран путем деления числа смертей за день на число зарегистрированных случаев за 14 дней до выбранной даты, чтобы учесть интервал между появлением симптомов и смертью. Три даты были выбраны – дата, приблизительно соответствующая максимуму на кривой числа смертей (А), дата минимума на этой кривой (B), и 25 июля (С, самые новые данные на момент составления таблиц). Если минимума не было (обычно его не было) точка B соответствовала значительному спаду числа смертей на кривой.
Кривые с максимумом и спадом характерны для западных стран. Для стран, где число случаев заболевания и смертей продолжает расти, точки А и В соответствуют начальному периоду эпидемии и середине кривой между А и С. Для Пакистана использована еще точка, предшествующая по времени точке А (pre-A), потому что хотя пакистанская кривая и имеет максимум, она «поднимается» к нему очень медленно, совсем не так, как кривые в Европе и США. Для определения числа заболеваний и смертей я использовал кривые, показывающие усредненные данные за 7 дней, чтобы скомпенсировать чрезмерное «дрожание стрелки осциллографа». Все данные с сайта Worldometer, где вы можете найти все кривые для ближайшего рассмотрения.
Вот примеры характерных кривых:
США – подъем, пик, спад и новый подъем для числа новых выявленных случаев и смертей на каждый день
Франция – подъем, пик и постепенный спад почти к нулю для случаев и смертей
Швеция – кривая смертей похожа на ту, что во Франции, но зависимость числа новых случаев от времени очень вычурная: подъем, за которым следует длительное плато, новый подъем к более высокому плато и, наконец, спад
Россия – подъем, пик и медленное снижение у графика числа новых выявленных случаев, и подъем и пологое плато у графика смертей
Индия – пока только подъем
Результаты расчетов приведены в таблице 1.
Прежде чем
обсуждать результаты, приведенные в таблице 1, замечу, что
изменение интервала между регистрацией случая и смертью с 14 суток
до семи или даже до нуля (описывает ситуацию, когда случаи
подтверждаются лабораторными анализами с большим опозданием и
регистрируются датой подтверждения примерно в тот же день, когда
больной умирает) не меняет результаты качественным образом. В
таблице 2 приведены результаты по нескольким странам и всему миру,
рассчитанные для интервалов 14, 7 и 0 суток. Сказав это сразу,
чтобы не испытывать читателя вопросом, правильно ли выбран этот
интервал, вернусь к таблице 1.
Цифры все могут
прочитать и без моей помощи, поэтому перейду к наблюдениям.
Расчетный коэффициент летальности снижается от момента пика на
кривой числа ежедневных смертей до текущего момента по крайней
мере в 3-4 раза (а иногда и в десятки раз) для всех европейских
стран и США, а также для всего мира (что неудивительно, поскольку
бОльшая часть смертей, связанных с ковидом, имела место в Европе и
США). Текущий показатель летальности в Европе и США составляет
около 2%. Из этой картины есть несколько исключений. Так,
летальность в Великобритании до сих пор составляет более 10%.
Напротив, летальность на пике числа смертей в Германии составляла
всего 6%. Эта последняя особенность коррелирует с низкой
смертностью, связанной с ковидом, в Германии.Сравнивая европейские/североамериканские данные с данными по остальным странам, мы обнаруживаем наличие второго типа зависимости коэффициента летальности от времени. В России в течение всей эпидемии летальность оставалась без изменений на уровне 1,5-2%. В Белоруссии (это Республика Беларусь, если что) наблюдается тот же тип зависимости с некоторой поправкой на наличие Батьки; летальность изначально была еще ниже, несколько увеличившись только в последнее время, но в целом ее значение не превосходит того, что наблюдается в России.
Крупные страны-соседи из Азии (Индия и Пакистан) и Южной Америки (Бразилия и Аргентина) я привел в качестве примера развивающихся стран. В целом, летальность в ранний период эпидемии для них ниже, чем для Европы и Северной Америки (Бразилия составляет исключение со значением, близком к тому, что наблюдалось в США). Более того, хотя тип зависимости летальности от времени развития эпидемии для Бразилии и Пакистана более соответствует евро/североамериканскому типу (тип 1), для Индии и Аргентины он промежуточный между типами 1 и 2. Тип изменений коэффициента летальности во времени не привязан жестко к смертности. Смертность в Россию, с ее вторым типом, превосходит смертность в Польше и Пакистане и приблизительно равна смертности в Германии – странах с первым типом зависимости.
Как я уже заметил, варьирование длительности интервала между регистрацией заболевания и смертью в пределах от 14 до 0 дней) не изменяет общей картины. Из таблицы 2 видно, что США и Франция показывают зависимость первого типа и снижение летальности в 5-6 раз и 15-30 раз, соответственно, в то время как летальность в России остается неизменной независимо от принятого интервала.
Для того, чтобы убедиться в том, что я не пропустил интересные части кривой зависимости летальности от времени, я определил летальность для бОльшего числа точек на этой кривой для нескольких стран с разными характером зависимости смерти от ковида от продолжительности эпидемии: США – пик, спад и новый подъем; Франция – пик и спад к нулю; Германия – то же, что и во Франции, но значения гораздо ниже; Швеция - то же, что и во Франции и Германии, но с другой формой зависимости числа новых случаев от времени (подъем, длительное плато, новый подъем к более высокому плато и спад). Таблица 3 показывает, что детальный анализ показывает ту же закономерность, что и анализ «широкими мазками».
Изменение
коэффициента летальности может быть связано со статистическими
проблемами. В самом начале эпидемии регистрировались только тяжелые
случаи; тестирование проводилось только в случае обращения в
больницу при наличии характерных симптомов; инфицированные, которые
переносили ковид асимптоматически, или болели, но оставались дома,
т.е. огромное большинство инфицированных, выпадали из статистики
новых случаев.В то же время число умерших от ковида было, вероятно, преувеличено. При наличии коронавируса у умершего причиной смерти считался ковид. Также, в число жертв ковида включали больных с симптомами ковида независимо от подтверждения инфекции анализом, хотя симптомы ковида не слишком специфичны. Более того, в Нью-Йорке в статистику включали смерти жителей города, которые произошли в других местах, хотя эти смерти могли быть включены в статистику тех мест, где они произошли. Вклад статистики в начальные значения CFR может быть велик. Не исключено, что исключительно низкое по сравнению с другими западноевропейскими странами значение летальности на начальных стадиях эпидемии в Германии (6 в Германии против 30-40 у соседей) связано не только с орднунгом в поведении населения, но и с бОльшим порядком в медицинской статистике?
Еще одно популярное объяснение этого явления заключается в разной доле населения, принадлежащей к группе риска. Иногда это формулируется так «вирус уже убил всех, кого мог». Хотя зависимость от первого вполне возможна, второе вряд ли справедливо. Посмотрим на долю самой чувствительной к ковиду демографической группы – мужчин от 75 лет и старше. В США и Западной Европе она составляет от ~3 до ~5% всего населения, а в Индостане - менее 1%, что говорит в пользу наличия некой корреляции. Но в Пакистане (0,7% мужчин от 75 лет и старше) летальность зависит от времени по первому типу, а в России, где доля этой группы населения в 2,5 выше – по второму. В Германии доля этой группы населения выше, а летальность на ранней стадии эпидемии и ковидная смертность ниже, чем в других западных странах. Поэтому зависимость не слишком проста.
Речь не идет, разумеется, и о том, что все из группы высокого риска уже умерли. Смертность от ковида в Западной Европе составляет обычно около 0,05% населения. При этом доля только мужчин в возрасте от 75 лет в этих странах около 4%. Если учесть, что в группу риска входят и другие категории населения, то ее численность практически не изменилась.
Более вероятна зависимость высокой летальности на ранних стадиях эпидемии от числа проживающих в различных типах домов престарелых, но искать и изучать эти данные мне лень. Тем более, что не менее важным фактором может быть их организация в разных странах. Замечу только, что в США около 5% лиц в возрасте 65 и более лет проживают в домах престарелых. Если это верно и для мужчин >75 лет, то доля этой группы самого высокого риска (мужчины >75 лет, проживающие в домах престарелых) во всем населении составляет около 0,15%. Учитывая, что они далеко не единственные жертвы эпидемии, даже для этой группы населения смертность от ковида вряд ли превышает 10%. Так что утверждение о том, «все, кто мог, уже умерли».
Вполне вероятно, что все указанные факторы и многие другие влияют на снижения наблюдаемой летальности. Но меня результаты заинтересовали по другой причине. Коэффициент летальности снизился до величины около 2% (медианная величина для выборки, представленной в Таблице 1 равна 2,35). В России он был таким с самого начала эпидемии. Что если эта величина и составляет реалистичную летальность ковида, определенную по числу выявленных случаев?
Более важным при оценке опасности/смертельности инфекционного заболевания является infection fatality risk/rate (IFR) – характеристика «истинной летальности», определяемой как число смертей от заболевания к общему числу заболевших. Последнее далеко не равно числу выявленных случаев, поскольку многие зараженные могут даже не знать об этом, а если и чувствуют себя неважно, вполне могут переболеть, не обращаясь ко врачу. Общее число инфицированных определить непросто. Его можно оценить, например, по результатам скрининга (больших) случайных выборок на наличие антител к вирусу, сигнализирующих о том, что человек был инфицирован и переболел. Для ковида число лиц, не обратившихся к помощи врача, по всей вероятности, во многие разы выше числа тех, у кого болезнь была выявлена. В результате, летальность ковида, определенная по числу инфицированных, несомненно составляет гораздо менее 1%, возможно около 0,2%.
В общем, меня зацепил любопытный факт – летальность по выявленным случаям в России на протяжении всей эпидемии (разумеется, никто не знает, какие изменения произойдут в будущем) была приблизительно равна величине, до которой этот параметр снизился в западных странах после пика и спада на графике текущего числа умерших от ковида.
УЙДИСЛОВИЕ:
Вот как раз ссылка поспела, чтобы приложить к этому посту.
Сохранено
|
|
</> |
Об особенностях национальных коронавирусных инфекций
Оставить комментарий
Популярные посты:
Классическая пицца: секрет вкуса, который покорил мир 
COVID-19. Что получилось и что не получилось. Часть 4 – чем лечить, когда 
Про славные ковидные времена 
Вакцина от COVID может быть запрещена для всех американцев 
COVID-19. Что получилось и что не получилось. Часть 3 – маски и намордники 
COVID-19. Что получилось и что не получилось. Часть 1в – Как хорошо на 
COVID-19. Что получилось и что не получилось. Часть 2 – больные и заразные 
Квиз "Минздрав предупреждает" - 5 
8 марта 2022 Предыдущие записи блогера :
12.07.2020 —
С праздником!
05.07.2020 —
Недоумеваю в день Четвертого июля
Посты по теме:
- Роспотребнадзор: коронавирус погибает в воде за 72 часа Коммерсантъ
- Ученые выяснили, в какой воде гибнет коронавирус Газета.Ru
- В 'Векторе' определили срок гибели коронавируса в воде РИА НОВОСТИ
- В Роспотребнадзоре рассказали, когда коронавирус погибает в воде RT на русском
- Ученые выяснили продолжительность жизни коронавируса в воде Российская Газета
- Посмотреть в приложении "Google Новости"
Архив записей в блогах:
почему излишества? а вспомнила фразу из "Кавказской пленницы" - алкоголь, сигареты, излишества всякие нехорошие ))) Посмотреть на Яндекс.Фотках так что сегодня пост, скорее всего, для мальчиков)) хотя, я тоже кое-что из ниже представленного помню)) Посмотреть на ...
Алматы - это сердце Казахстана, древний и современный город, объединяющий в себе историю, культуру и динамичный ритм жизни. Здесь каждый найдет что-то особенное: уникальные памятники архитектуры, живописные уголки природы, современные развлечения и захватывающие виды. Но если вы ...
Сегодня 04 августа появилась первая реальная жертва западных санкций против РФ - авиакомпания "Добролёт". Авиакомпания "Добролет" с 04 августа приостановила все полеты. Об этом сообщено на сайте учредителя - компании "Аэрофлот". "В связи с применением экономических санкций, введенных ...
Ну вроде же простой вопрос. Любому вменяемому человеку очевидно что ЕГЭ и ОГЭ провести дистанционно нельзя, так как физически не проконтролируешь, чем экзаменуемый пользуется. То есть их надо собирать. Но все страны боятся второй волны коронавируса, а как раз выпускники не столько ...
НАТО может вернуть в Европу ядерные наземные ракеты средней и меньшей дальности. Для России это очень плохо. После почти 30 лет затишья группа ядерного планирования НАТО вновь оказалась в центре актуальной политики и общественного внимания. Пентагон уже несколько лет утверждал, ...
