Без названия

cryptopolicy — 18.10.2025

...

В дополнение к посту Секвенирование вирусного генома: cryptopolicy — ЖЖ

Оттуда:

«при использовании ПЦР для множения секвенируемых фрагментов из-за ошибок фермента ДНК-полимеразы возникают несуществующие фрагменты, которые затем могут трактоваться, как мутации вируса. Артефактность ПЦР зависит от числа циклов, но стандартизации нет, и в вирусологии часто используется недопустимое число циклов.»

При ПЦР возникает еще и рекомбинация матриц. 

Из Рекомбинация ДНК при ПЦР - Archive ouverte HAL:

"ПЦР-коамплификация двух различных последовательностей генов HIV1 tat приводит к образованию рекомбинантных молекул ДНК. Частота таких рекомбинантов, составляющая до 5,4% от всех амплифицированных молекул, может быть снижена в 2,7 раза за счет увеличения времени удлинения Taq-ДНК-полимеразы в 6 раз ... ПЦР-опосредованная рекомбинация может быть проблемой при изучении гетерогенного генетического материала, такого как РНК-вирусы [при секвенировании РНК-вирусов используется ПЦР и там всегда именно гетерогенный материал, так как технология очистки вируса не позволяет его отделить от клеточных фргаментов, содержащих РНК ], мультигенные семейства или повторяющиеся последовательности. Это явление может быть использовано для создания химерных молекул [склеивания коротких фрагментов ДНК в одну длинную артефактную ДНК] из родственных последовательностей."

Оставить комментарий

Популярные посты:

thurinus

Тихий и чистый город: как EV-революция изменит улицы, парковки и энергосистему

smapse

10 интересных фактов о новогодней ёлке

ljubov_i_svet

Неизменно красивая русская женщина

ametist_w

Спрятался

ogbors

Планета на распутье: что дальше?..

matsam

Вечернее

v_pychick

когда они пришли

matsam

Побег из Гренландии

glukovarenik

Однако за время пути...

• Ранее
• Архив